威廉·夏特纳

2285年，在与可汗的战斗中损坏的联邦星舰进取号，返回了地球的太空港以进行维修。柯克还在为史波克的死感到悲伤。麦考伊医生出现了种种异常的行为：如擅自闯入被封锁的史波克原来的舱房、胡言乱语等，最后他被送进了医院进行精神检查...

星际联邦的大敌克林贡帝国因为连年争战，经济及生态环境破坏殆尽，一位克林贡领袖遂在进取号星舰的护送下前往地球谈和，中途却遭到阴谋份子暗杀，并且嫁祸进取号…

一名神秘的疯狂幻想家赛波克占领了一个遥远的星球，劫持星际大使作人质，强迫进取号号宇宙飞船紧急出发，进入没有人做访过的未知宇宙去寻找传说中的上帝，但上帝到底是谁呢？正在基地修整的进取号接受了一项紧急任务，柯克船长一行奉命解救遭到叛徒控制的市民，叛军挟持了进取号到银河系中心去寻找根源。